Ngày 28/12/2018, Bộ Y tế đã ban hành Thông tư 49/2018/TT-BYT quy định về hướng dẫn hoạt động xét nghiệm trong khám, chữa bệnh (có hiệu lực từ ngày 15/3/2019). Thông tư này hướng dẫn việc quản lý hoạt động xét nghiệm, nhiệm vụ của các chức danh chuyên môn của hoạt động xét nghiệm trong khám bệnh, chữa bệnh, áp dụng đối với các cơ sở khám bệnh, chữa bệnh có hoạt động xét nghiệm phục vụ cho việc khám bệnh, chữa bệnh và bãi bỏ một số nội dung liên quan đến hoạt động khoa Xét nghiệm ban hành tại Quy chế bệnh viện.

Giám đốc các bệnh viện và các cơ sở khám, chữa bệnh cần lưu ý một số nội dung sau:
Về hình thức tổ chức thực hiện hoạt động xét nghiệm:

Ngoài hình thức tổ chức phòng xét nghiệm độc lập, xét nghiệm tại các trạm y tế xã, phường, thị trấn, phòng khám và các hình thức tổ chức khác thì khoa xét nghiệm của các bệnh viện có thể là: (a) khoa xét nghiệm riêng cho từng loại xét nghiệm; (b) khoa hay trung tâm xét nghiệm cho nhiều loại xét nghiệm; (c)  khoa xét nghiệm nhiều loại xét nghiệm kết hợp với các chuyên khoa cận lâm sàng khác.

Riêng đối với các bệnh viện công lập hoặc ngoài công lập có tổ chức khoa Vi sinh hoặc bộ phận xét nghiệm Vi sinh thì áp dụng thêm các quy định riêng về hoạt động xét nghiệm vi sinh trong bệnh viện theo quy định tại Thông tư 33/2016/TT-BYT.

Về nhiệm vụ của trưởng khoa xét nghiệm:
Thông tư quy định rõ người trưởng khoa xét nghiệm phải: Chỉ đạo, tổ chức hoạt động của khoa theo đúng nội dung quản lý hoạt động xét nghiệm; Phối hợp với các khoa lâm sàng và khoa khám bệnh tổ chức công tác lấy và tiếp nhận mẫu bệnh phẩm, công tác thường trực xét nghiệm và phòng chống dịch liên tục 24 giờ/ngày; Xây dựng và định kỳ cập nhật các quy trình quản lý chất lượng xét nghiệm, quy trình kỹ thuật, hướng dẫn chuyên môn để thủ trưởng cơ sở ban hành và áp dụng tại khoa xét nghiệm; và có nhiệm vụ trong tổ chức, phối hợp với các khoa, phòng khác trong quản lý mua sắm, tiếp nhận trang thiết bị, hoá chất cho hoạt động xét nghiệm.

Riêng về ký kết quả xét nghiệm, Thông tư có quy định trưởng khoa xét nghiệm trực tiếp ký kết quả xét nghiệm hoặc phân công bác sỹ chuyên khoa xét nghiệm, kỹ thuật viên xét nghiệm có trình độ đại học trở lên ký kết quả xét nghiệm theo quy định.
Về đảm bảo chất lượng xét nghiệm:
Đối với các xét nghiệm nhanh, thực hiện xét nghiệm tại chỗ tại các khoa lâm sàng trong các trường hợp cấp cứu, sàng lọc, trong theo dõi người bệnh do nhân viên y tế thực hiện ghi vào hồ sơ và bác sĩ chỉ định xét nghiệm ký kết quả và phải bảo đảm về giám sát chất lượng xét nghiệm đối với loại hình xét nghiệm này.
Các quy trình về quản lý chất lượng xét nghiệm, quy trình kỹ thuật, hướng dẫn chuyên môn (bao gồm các hướng dẫn thực hiện xét nghiệm; quy trình tiếp nhận – xử lý, trả kết quả; quy định về quản lý và sử dụng hóa chất, trang thiết bị…; quy trình lưu trữ, hủy bệnh phẩm, hóa chất, thuốc thử…sau xét nghiệm… ) đều phải được xây dựng, cập nhật định kỳ và do Giám đốc đơn vị ban hành và áp dụng. Các bước xây dựng quy trình, mẫu quy trình chuẩn trong quản lý chất lượng xét nghiệm đã được Bộ Y tế ban hành tại Quyết định số 5530/QĐ-BYT ngày 25/12/2015.